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Conference papers

Propagation du virus de l'hépatite E de la case à la filière : analyse de réseaux complexes et modélisation

Résumé : L'hépatite E est une zoonose très répandue chez les porcs et potentiellement grave chez l'homme. La transmission entre porcs se fait par voie fécale-orale, par contact direct ou via l'environnement. Le principal facteur de propagation entre exploitations est le transport d'animaux vivants. La chaîne de production porcine est constituée de nombreux acteurs interconnectés, formant un réseau complexe structuré dans l'espace et le temps. Cette étude vise à tester des scénarios de contrôle à l'échelle nationale en prenant en compte les différentes voies de transmission ainsi que les mouvements d’animaux vivants. Les mouvements de porcs de 2017 à 2020 fournis par la base de données nationale française de traçabilité des porcs (BDporc) ont été analysés. Des modèles de graphes aléatoires exponentiels ont été ajustés pour trois sous-ensembles définis par le type d'animaux transportés (truies, porcelets et porcs en croissance) afin d’évaluer les probabilités de contact entre élevages. Les résultats ont été validés par la validation croisée d’une analyse de la qualité de l'ajustement des modèles et de cartes. Les probabilités de contact estimées ainsi que les caractéristiques générales des systèmes d'élevage en bandes ont permis de construire un modèle démographique simulant les mouvements de porcs à trois niveaux : entre cases, entre secteurs de production et entre élevages selon une horloge déterministe, mais avec des destinations aléatoires pondérées par les probabilités de contact. Enfin, la dynamique simulée a permis d’alimenter un modèle épidémiologique stochastique multi-niveaux simulant la transmission intra- et inter-cases. La prévalence des porcs positifs au virus de l’hépatite E transportés à l'abattoir a été estimée pour différents scénarios de contrôle afin d'évaluer, à terme, l'efficacité de mesures de biosécurité mises en place en élevage.
Keywords : Hepatitis E Pig Spread
Document type :
Conference papers
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https://hal-anses.archives-ouvertes.fr/anses-03845204
Contributor : Françoise Duborgel Connect in order to contact the contributor
Submitted on : Wednesday, November 9, 2022 - 12:42:30 PM
Last modification on : Wednesday, November 16, 2022 - 5:43:15 PM

Identifiers

  • HAL Id : anses-03845204, version 1

Citation

Pachka Hammami, Stefan Widgren, Vladimir Grosbois, Andrea Apolloni, Nicolas Rose, et al.. Propagation du virus de l'hépatite E de la case à la filière : analyse de réseaux complexes et modélisation. 54. Journées de la Recherche Porcine, Feb 2022, en ligne, France. pp.339-344. ⟨anses-03845204⟩

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